Возникла во второй половине 20-х гг. ХХ в. Создатели теории - Н.С. Трубецкой, Р.О. Якобсон. ПФШ разрабатывалась идея нейтрализации фонем. В позиции нейтрализации, с точки зрения ПФШ, выступают архифонемы - особые фонологические единицы, отличные от фонем, обладающие иным набором дифференциальных признаков. По ПФШ, фонема - пучок дифференциальных признаков. Архифонема состоит из дифференциальных компонентов, общих для нейтрализованных фонем (у слов прут и пруд один и тот же фонологический состав < пруТ> - фонемы < п>, < р>, < у> и архифонема < Т>. ПФШ разрабатывает теорию оппозиций фонем. В основе учения - сигнификативная функция фонемы, в отличие от МФШ, где основой учения является перцептивная функция.